在前期反复调研和专家咨询的基础上，由同济大学建筑设计研究院设计完成的中科院嘉兴中心总平面方案和一期建设设计方案，于2005年5月18日通过嘉兴市城市规划委员会评审。同时该项目已正式启动申报省重点工程项目。
　　中科院嘉兴中心位于嘉兴科技城东侧北部地块，规划占地约300亩，北至嘉兴城市主轴中环南路、南至二号路、西至亚太路、东至王庙塘。布局上分A、B、C、D四个区块，设置科研办公、科技孵化、配套服务设施、综合会所等相关功能建筑。整个园区建筑以自由错落的简洁体量建筑为特色，科研楼大小变化，高低错落，营造现代科研建筑特色的整体风格。中央综合服务带以流畅的曲线造型为特色，外部空间呈现自由错落的园林化特色，景观及院落空间大小串联，体现现代科技园区的生态取向。
　　中科院嘉兴中心一期建设设计方案总规划用地面积约30000平方米，总设计建筑面积约28300平方米，主要用于安排8个研究所科研办公用房及配套服务设施。设计有报告厅、会议厅、图书情报中心、员工餐厅、健身房和专家公寓等。